补中益气汤作为补气升阳的代表方，近年来在调节肠道微生态方面受到广泛关注。临床研究显示，该方能显著改善肠易激综合征（IBS）患者的腹痛、腹泻症状，并提高生活质量。机制研究表明，其通过调节肠道菌群结构，增加有益菌丰度，修复肠黏膜屏障，从而减轻肠道炎症。这一发现为传统补气方剂治疗消化系统疾病提供了现代科学依据。
在免疫功能调节方面，补中益气汤被证实能增强机体非特异性免疫与特异性免疫反应。对于慢性疲劳综合征患者，临床观察提示其能改善乏力、头晕等症状，提升免疫功能指标。然而，其疗效在不同亚型患者中存在差异，对于湿热内蕴或实热证患者，服用该方可能助火生热，加重症状，这再次强调了辨证施治的重要性。
安全性评价显示，补中益气汤总体安全性良好，偶见轻微上火或胃肠不适。但对于高血压患者，需警惕黄芪等升提药物可能导致的血压波动。此外，方中部分成分可能与免疫抑制剂发生相互作用，影响移植患者的免疫状态。因此，对于合并多种基础疾病或正在接受免疫治疗的患者，应在医师指导下谨慎使用。
当前研究正深入探索补中益气汤通过肠脑轴调节中枢神经功能的机制，这为其在精神心理疾病中的应用提供了新视角。未来需开展更多机制明确、设计严谨的临床试验，明确其在不同疾病阶段的最佳干预时机。临床应用中，应结合患者体质与病情，灵活加减，避免机械套用，以实现个体化精准治疗。