网络药理学已成为解析针灸多靶点机制的重要工具，通过构建成分-靶点-通路网络，预测其在抗炎、镇痛中的潜在作用。然而，大量研究仅停留在生物信息学预测层面，缺乏湿实验验证，导致机制阐释停留在理论模型，难以直接指导临床实践。
临床表型与分子机制之间存在显著脱节。针灸通过物理刺激调节神经-内分泌-免疫网络，其效应具有动态性和整体性，难以用静态的分子通路完全概括。现有研究常将动物模型的炎症因子变化直接等同于人类疼痛缓解，忽略了物种差异及安慰剂效应的干扰。
体外细胞实验与体内动物模型的结果，往往无法准确反映人体复杂生理环境。例如，针灸对局部微循环的改善可能在动物模型中显著，但在人体中受个体血管条件、心理状态等多重因素影响。因此，单纯依赖计算生物学预测，易产生过度解读，忽视临床实际疗效的个体差异。
建议将网络药理学作为假设生成工具，而非结论依据。后续研究应结合转录组学、代谢组学等多组学技术，在严格设计的临床试验中验证预测通路。同时，需引入真实世界研究数据，评估针灸在长期管理中的实际价值，避免将计算预测结果直接转化为临床推荐。